?? 免疫腫瘤學(xué)的發(fā)展使免疫療法成為癌癥治療的有力工具。目前，在腫瘤免疫治療中開(kāi)發(fā)的大多數(shù)藥物是阻斷T細(xì)胞檢查點(diǎn)受體及其同源配體的單克隆抗體。然而，并非所有患者都能從這些藥物中獲益，而且它們存在一定的副作用。為了解決這些問(wèn)題，小分子方法已被提出作為輔助治療，它是生物制劑的補(bǔ)充，并顯示出潛在的協(xié)同效應(yīng)。小分子可以調(diào)節(jié)適應(yīng)性和先天免疫系統(tǒng)，并最終影響腫瘤微環(huán)境中事件的進(jìn)程。與生物制劑相比，小分子藥物具有可行性高、腫瘤微環(huán)境暴露量大、劑型多樣、成本低等優(yōu)勢(shì)。這些優(yōu)點(diǎn)說(shuō)明小分子在腫瘤免疫治療中存在機(jī)會(huì)。研究表明，中藥在免疫調(diào)節(jié)中起著重要作用，說(shuō)明它們?cè)诎┌Y免疫治療中具有廣闊的前景。

? ? ??本文介紹一個(gè)中藥免疫腫瘤學(xué)綜合數(shù)據(jù)庫(kù)TCMIO, 供研究腫瘤免疫學(xué)的同學(xué)們參考。數(shù)據(jù)庫(kù)相關(guān)論文于2020年4月發(fā)表在Frontiers in Pharmacology雜志上

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一、數(shù)據(jù)庫(kù)的整體框架

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? ? ? ? TCMIO數(shù)據(jù)庫(kù)的整體框架見(jiàn)下圖。

? ? 首先從文獻(xiàn)中提取腫瘤免疫學(xué)靶標(biāo)（IO靶標(biāo)）。對(duì)于每個(gè)靶標(biāo)，使用公共數(shù)據(jù)庫(kù)UniProt對(duì)蛋白名稱和基因名稱進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。然后從ChEMBL (version 24.0) 數(shù)據(jù)庫(kù)中提取作用于每個(gè)IO靶標(biāo)的配體，活性閾值設(shè)定為10um, 活性類型僅包括Ki、Kd, IC50, C50，和potency。方劑和中藥均取自《中國(guó)藥典》(2015版)。利用Kew藥用植物名稱服務(wù)(Kew Medicinal Plant Names Services）收集中藥的種名。化學(xué)成分從TCMAnalyzer 下載，該軟件整合了TCMSP和TCMID的數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)庫(kù)還綜合分析了中藥與腫瘤免疫的關(guān)系。51xxziyuan.com

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二、數(shù)據(jù)量統(tǒng)計(jì)

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數(shù)據(jù)庫(kù)包含的各種類型的數(shù)據(jù)的數(shù)量統(tǒng)計(jì)見(jiàn)下表。

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總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的中药免疫肿瘤学数据库，TCMIO使用指南的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

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