python大数据论坛_干货 | Python+大数据计算平台,PyODPS架构手把手教你搭建
數據分析和機器學習
大數據基本都是建立在Hadoop系統的生態上的,其實一個Java的環境。很多人喜歡用Python和R來進行數據分析,但是這往往對應一些小數據的問題,或者本地數據處理的問題。如何將二者進行結合使其具有更大的價值?Hadoop現有的生態系統和現有的Python環境如上圖所示。
MaxCompute
MaxCompute是面向離線計算的大數據平臺,提供TB/PB級的數據處理,多租戶、開箱即用、隔離機制確保安全。MaxCompute上主要分析的工具就是SQL,SQL非常簡單、容易上手,屬于描述型。Tunnel提供數據上傳下載通道,不需要經過SQL引擎的調度。
Pandas
Pandas是基于numpy的數據分析的工具,里面最重要的結構是DataFrame,提供一系列繪圖的API,背后是matplotlib的操作,非常容易和Python第三方庫交互。
PyODPS架構
PyODPS即利用Python進行大數據分析,其架構如上圖所示。底層是基礎API,可以利用其操作MaxCompute上的表、函數或者資源。再上面是DataFrame框架,DataFrame包括兩部分,一部分是前端,定義了一套表達式的操作,用戶寫的代碼會轉化成表達式樹,這與普通的語言是一樣的。用戶可以自定義函數,也可以進行可視化,與第三方庫進行交互。后端最下面是Optimizer,其作用是對表達式樹進行優化。ODPS和pandas都是通過compiler和analyzer提交到Engine來執行。
背景
為什么要做DataFrame框架?
對于任何一個大數據分析工具,都會面臨三個維度上的問題:表達力,API、語法、編程語言是否簡單、符合直覺?數據,存儲、元數據是否能壓縮、有效?引擎,計算的性能是否足夠?所以就會面臨pandas和SQL兩個選擇。
如上圖所示,pandas的表達力非常好,但是其數據只能放在內存中,引擎是單機的,受限于本機的性能。SQL的表達力有限,但是可以用于大量的數據,數據量小的時候沒有引擎的優勢,數據量大的時候引擎會變得很有優勢。ODPS的目標是綜合這兩者的優點。
PyODPS DataFrame
PyODPS DataFrame是使用Python語言寫的,可以使用Python的變量、條件判斷、循環。可以使用pandas類似的語法,定義了自己的一套前端,有了更好的表達力。后端可以根據數據來源來決定具體執行的引擎,是visitor的設計模式,可擴展。整個執行是延遲執行,除非用戶調用立即執行的方法,否則是不會直接執行的。
從上圖中可以看出,語法非常類似于pandas。
表達式和抽象語法樹
從上圖可以看出,用戶從一個原始的Collection來進行GroupBy操作,再進行列選擇的操作,最下面是Source的Collection。取了兩個字段species,這兩個字段是做By操作的,pental_length是進行聚合的操作取聚合值。Species字段是直接取出來,shortest字段是進行加一的操作。
Optimizer(操作合并)
后端首先會使用Optimizer對表達式樹進行優化,先做GroupBy,然后在上面做列選擇,通過操作合并可以去除petal_length做聚合操作,再加一,最終形成了GroupBy的Collection。
Optimizer(列剪枝)
用戶join了兩個data frame,再取來自data frame 的兩個列的時候,如果提交到一個大數據的環境,這樣一個過程是非常低下的,因為不是每個列都用到了。所以要對joined下的列進行剪枝操作。比如,data frame1我們只用到了其中的一個字段,我們只需要將字段截取出來做一個projection來形成新的Collection,data frame2也類似。這樣,對這兩部分進行校驗操作的時候就能極大的減少數據的輸出量。
Optimizer(謂詞下推)
如果對兩個data frame進行joined然后再分別進行過濾的話,這個過濾操作是應該下推到下面來執行的,這樣就能減少joined 的輸入的量。
可視化
提供了visualize()來方便用戶進行可視化。在右邊的例子中可以看到,ODSP SQL后端會compile成一條SQL執行。
后端
從上圖中可以看出,計算后端是非常靈活的。用戶甚至可以joined一個pandas的data frame和maxcompute上一個表的數據。
Analyzer
Analyzer的作用是針對具體的后端,將一些操作進行轉化。比如:
有些操作比如value_counts,pandas本身支持,因此對于pandas后端,無需處理;對于ODPS SQL后端,沒有一個直接的操作來執行,所以在analyzer執行的時候,會被改寫成groupby + sort的操作;
還有一些算子,在compile到ODPS SQL時,沒有內建函數能完成,會被改寫成自定義函數。
ODPS SQL后端
ODPS SQL后端怎么進行SQL編譯再執行的操作?編譯器可以從上到下遍歷表達式樹,找到Join或者Union。對于子過程,進行遞歸compile。再到Engine來具體執行時,會使用Analyzer對表達式樹進行改寫,compile自上而下的子過程,自底向上compile成SQL子句,最終得到完整的SQL語句,提交SQL并返回任務。
pandas后端
首先訪問這個表達式樹,然后對每個表達式樹節點對應到pandas操作,整個表達式樹遍歷完之后就會形成DAG。Engine執行按DAG拓撲順序執行,不斷地把它應用到pandas操作,最終得到一個結果。對于大數據環境來說,pandas后端的作用是做本地DEBUG;當數據量很小時,我們可以使用pandas進行計算。
難點+坑
后端編譯出錯容易丟失上下文,多次optimize和analyze,導致難以查出是之前哪處visit node導致。解決:保證每個模塊獨?立性、測試完備;
bytecode兼容問題,maxcompute只支持Python2.7的自定義函數的執行;
SQL的執行順序。
ML機器學習
機器學習是輸入輸出一個data frame。比如,有一個iris的data frame,先用name字段來做一個分類字段,調用split方法將其分成60%的訓練數據和40%的測試數據。然后初始化一個RandomForests,其里面有一棵決策樹,調用train方法訓練訓練數據,調用predict方法形成一個預測數據,調用segments[0]就可以看到可視化結果。
總結
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