对于癌细胞进行单细胞测序的意义是什么?
生活随笔
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对于癌细胞进行单细胞测序的意义是什么?
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
這是因為在腫瘤組織中,癌細胞并不是均質的,癌細胞中的基因拷貝并不完全一致。以往的科學研究結果都認為癌癥是細胞水平上的單個克隆疾病,也就是說下一代的腫瘤細胞從上一代的腫瘤細胞遺傳模板完全復制而來。但是隨著研究的深入,越來越多的證據說明腫瘤組織中的癌細胞克隆存在差異性,其中有些克隆是可以快速擴散的,分析這些單細胞的克隆就能了解癌細胞轉移和復發的原因,以及它們抗藥性的產生。單細胞測序方法又稱single cell sequencing(SNS),可以對一個單細胞核中基因拷貝數目進行準確定量。癌細胞的部分基因組往往會被刪除,或者擴增,關鍵基因就會出現缺失,或者表達過量,正常細胞的生長被干擾,利用這種方法就可以分析基因拷貝數目,從而對癌癥做出診斷。就是因為單細胞測序的優越性,所以近年來成為了癌癥研究的熱點之一。比如,中國深圳華大基因研究院的研究人員對典型的JAK2陰性ET病人的90個單細胞進行了全外顯子測序,測序結果鑒定了一些與ET的發生、發展相關的突變基因,并揭示了此ET在腫瘤發生中遵循單克隆演化模型。也有科研人員對腎透明細胞癌進行了單細胞測序,發現試驗者的腎癌并不是由常見的兩個突變基因VHL和PBRM1導致,這說明癌癥個性化治療的重要性。測序結果發現此腎癌中沒有明顯的克隆(細胞)亞群,并且發現了一些與此腎癌發生相關的重要功能基因。
腫瘤的單細胞測序,最主要的作用還是研究腫瘤發生、發展的機理,以及腫瘤細胞的特異性的治療靶點。單細胞全基因組測序技術是在單細胞水平對全基因組進行擴增與測序的一項新技術。其原理是將分離的單個細胞的微量全基因組DNA進行擴增,獲得高覆蓋率的完整的基因組之后通過外顯子捕獲進而高通量測序用于揭示細胞群體差異和細胞進化關系。之前的測序以及各種基因組計劃,使用的測序材料無一例外都是數百萬甚至更多細胞的混合DNA樣本。這種方法能夠得到全基因組序列信息,但是對其進行研究得到的結果只是一群細胞中信號的平均值,或者只代表其中占優勢數量的細胞信息,單個細胞獨有的特性被忽視。例如,科學家想找出哪種突變存在于哪種細胞中幾乎是不可能的,只存在于少數細胞(如早期癌細胞)中的突變也基本上被掩藏。另一方面,有些樣品稀少無法在實驗室培養,樣品量不足以進行全基因組分析,例如腫瘤循環細胞、組織微陣列、早期發育的胚胎細胞等。這些都是全基因組測序遇到的難題。作為“在單個細胞水平上對基因組進行測序”的單細胞測序技術能夠解決上述難題。與傳統的全基因組測序相比,單細胞測序不僅測量基因表達水平更加精確,而且還能檢測到微量的基因表達子或罕見非編碼RNA,其優勢是全方位和多層次的。
腫瘤的單細胞測序,最主要的作用還是研究腫瘤發生、發展的機理,以及腫瘤細胞的特異性的治療靶點。單細胞全基因組測序技術是在單細胞水平對全基因組進行擴增與測序的一項新技術。其原理是將分離的單個細胞的微量全基因組DNA進行擴增,獲得高覆蓋率的完整的基因組之后通過外顯子捕獲進而高通量測序用于揭示細胞群體差異和細胞進化關系。之前的測序以及各種基因組計劃,使用的測序材料無一例外都是數百萬甚至更多細胞的混合DNA樣本。這種方法能夠得到全基因組序列信息,但是對其進行研究得到的結果只是一群細胞中信號的平均值,或者只代表其中占優勢數量的細胞信息,單個細胞獨有的特性被忽視。例如,科學家想找出哪種突變存在于哪種細胞中幾乎是不可能的,只存在于少數細胞(如早期癌細胞)中的突變也基本上被掩藏。另一方面,有些樣品稀少無法在實驗室培養,樣品量不足以進行全基因組分析,例如腫瘤循環細胞、組織微陣列、早期發育的胚胎細胞等。這些都是全基因組測序遇到的難題。作為“在單個細胞水平上對基因組進行測序”的單細胞測序技術能夠解決上述難題。與傳統的全基因組測序相比,單細胞測序不僅測量基因表達水平更加精確,而且還能檢測到微量的基因表達子或罕見非編碼RNA,其優勢是全方位和多層次的。
總結
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